您好,欢迎来到保捱科技网。
搜索
您的当前位置:首页胎儿先天性心脏病多个相关基因SNP位点突变的初步研究

胎儿先天性心脏病多个相关基因SNP位点突变的初步研究

来源:保捱科技网
生 旦箜 鲞筮 塑 _n』 1in Obstet Gynecol May 2014,Vo1.15,No.3 ・209- ・论著・ 胎儿先天性心脏病多个相关基因 SNP位点突变的初步研究 解琚淑 【摘要】 目的马瑞琼 裴秋艳 黄振宇 梁梅英 王建六 张晓红 研究多个先天性心脏病相关基因SNP位点与胎儿复杂先天性心脏病发生的关系。方法 选取2011年6月至2013年3月于北京大学人民医院妊娠中期或晚期超声胎儿系统筛查诊断为先天性心血管畸形 并行脐静脉穿刺者为先心组共30例,终止妊娠前行脐静脉穿刺留取胎儿脐血3~5 ml,同时留取胎儿父母静脉 血3~5 ml。按1:2随机选取同时期正常分娩病例6O例作为对照,分娩时留取脐静脉血3~5 ml。所有留取静 脉血均提取基因组DNA,检测所选择6O个基因位点突变情况。结果本研究发现突变位点主要集中在TBX20、 GATA4、GATA6、GLI1、CRELD 15个基因中,它们可能是北京附近人群的高突变基因。GLI1基因2101G ̄ A的杂合突变结果具有统计学意义,且与父母遗传相关性小,提示该基因位点的突变可能与先心病的发病密切 相关。结论步研究。 北京附近人群的高突变基因为TBX20、GATA4、GATA6、GLI1、CRELD1,GLI1基因2101G> A的杂合突变可能与先心病的发病相关度较高。多突变位点联合作用是否增加先心病发病风险还需扩大样本进 一【关键词】 先天性心脏病;基因突变;SNP位点;GLIt Primary study of multiple SNP gene mutation sites and congenital cardiovascular malformations XIE Junshu,MA Ruiqiong,PEI Qiuyan,HUANG Zhengyu,LIANGMeiying,WANG Jianliu,ZHANG Xiaohong. (Department of Obstetrics and Gynecology,Peking University People S Hospital,Beijing 100044,China) [Abstract] Objective To explore the genetic and correlation of multiple SNP gene mutation sites and con- genital cardiovascular malformations.Methods Congenital heart group included 30 cases with congenital heart dis— ease who registered in People’S Hospital of Peking University and underwent umbilical vein puncture or medium— term abortion from June 201 1 tO March 2013.The fetus cord blood and their parents’venous blood were collected. Randomly selecting 60 cases of normal delivery from the same period matched up one tO two as the control group, umbilical cord blood was collected during the childbirth.Genomic DNA was extracted and then the SNP locus muta— tions WSS detected.Results The study found that the mutation sites were mainly concentrated in the TBX2O,GA— TA4,GATA6,GLI1,CRELD1 genes,SO they might be the high mutant gene in the people near Beijing area.The GLI1 gene 21O1G>A heterozygous mutation resulted statistically significant between the tWO groups,and little re— lated to the parents,suggesting that this gene locus mutation might be related to the incidence of congenital heart disease closely.Conclusions TBX20,GATA4,GATA6,GLI1 and CRELD1 are five high mutant genes in people of Beijing area,and GLI1 gene 21O1G>A heterozygous mutation may be closely related with the incidence of con— genital heart disease.It needed further study whether the combined effects of multiple gene mutations locus in— creased the risk of congenital heart disease. [Key words] congenital heart disease(CHD);gene mutation;SNP sites;GLI1 Chin J Clin 0bstet Gyneco1,2014,15:209—212 先天性心脏病(CHD),指出生时即存在的心 血管系统结构畸形及功能异常,是目前新生儿最常 doi:10.13390/j.issn.1672—1861.2014.03.006 见的先天畸形之一Ⅲ,约占新生儿出生缺陷的 25 9/6,在出生缺陷的疾病构成中处于第l位 ,目 前公认先天性心脏病(简称先心病)是一种与环境 作者单位:100044北京大学人民医院妇产科 通信作者:张晓红Email:zhangxiaohong@pkuph.edu.cn 相关的、某些主要基因参与的多基因遗传病。由遗 传及孕期风险因素共同作用所导致的先心病占总数 2014年5月第15卷第3期Chin J Clin Obstet Gyneco1 Maj,2014,V . ! : 的75 ~90 [1]。目前研究多集中单纯先心病相 关单个基因测序,而缺乏复杂先心病多基因、多突 关基因共16个,包括NKX2.5、TBX1、TBX5、 TBX20、GATA4、GATA6、TFAP2B、GLI1、 变位点的联合检测,同时缺乏其父母有无突变位点 遗传情况的研究。本研究通过对16个先心病相关 基因6O个位点的联合检测,探讨多基因SNP突变 位点与胎儿复杂先心病发生关系,同时通过检测父 母基因突变情况明确其遗传关系。 资料与方法 一MTHFR、NOTCH1、JAG1、CRELD1、VEGF、 CITED2、MYH6、HAND2,均为既往文献中报 道的先心病相关高危基因[41¨,进一步选取所筛选 基因中经基因测序所得SNP位点共60个,突变率 在1 --79.3 ,这些位点在先心组和对照组间存 在统计学差异的概率在1.06 ~14.8 之间[4 。 选取突变检出率较高及突变在先心病患者与正常对照 组之间存在差异且检出率大于l 的位点。 4.SNP位点检测:所有SNP位点由博奥晶典 生物技术有限公司使用Sequenom公司的Genoty— 、研究对象 研究资料来源于2011年6月至2013年3月在 北京大学人民医院产科脐静脉穿刺患者共30例为 先心组,妊娠中期或晚期经产科超声胎儿系统筛查 诊断为先天性心血管畸形,留取脐血3~5 ml。同 时取父母静脉血各3~5 ml。另按1:2随机选取 ping Tools及MassARRAY Assay Design软件设 计PCR扩增引物及单碱基延伸引物,引物由上海英 骏生物公司合成。使用MALDI一,r( (matrix—as— sisted laser desorption/ionization—time of fligh,基 同时期正常分娩病例60例作为对照组,分娩时抽 取脐静脉血3~5 ml。 二、诊断方法及依据 产检者于孕20 ̄22周由具有产前诊断资质的 超声医师进行首次胎儿系统畸形筛查及胎儿心脏彩 色多普勒超声检查。根据国际妇产科超声学会 2006年制定的指南进行超声检查及诊断l3]。 三、实验方法 1.基因组DNA的提取:所获取胎儿、新生儿 质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱)分析,检测 结果使用TYPER 4.0软件分型并输出结果。 四、统计方法 采用SPSS1 6.0统计软件进行统计学处理。计 量资料结果采用均数±标准差表示;计数资料单因 素分析采用X 检验;数值资料采用样本 t检验;P%0.05认为差异具有统计学意义。 结 一以及先心组胎儿父母静脉血液标本3~5 ml均经 EDTA抗凝处理,使用天根生化有限公司提供的 血液DNA提取试剂盒提取全血标本中的基因组 DNA。 一果 、般情况 先心组与对照组病例中母亲平均孕龄、产次、 孕次及配偶平均年龄之间采用样本t检验,分 析结果的差异均无统计学意义。胎儿性别比较采用 X‘检验,P一0.705,差异均无统计学意义。可见 2.提取DNA琼脂糖凝胶电泳:取DNA MarkerIV 3 1及所得DNA产物各取2 l加样于 所制1 的琼脂糖凝胶中,检测所扩增DNA均无 先心组与随机选取的对照组孕妇在一般情况方面具 有可比性(表1)。 降解。 3.SNP位点选择;查阅文献,选取先心病相 表1先心组与对照组孕妇一般情况比较 志2014年5月第l5卷第3期Chin J In 堕 !! 型 ! : ! : 存在相应的差别。 经统计分析先心组与对照组中突变位点情况, 发现仅GLI1基因2101G ̄A的杂合突变结果具有 统计学意义。先心病高危基因位点的多态性报道屡 见不鲜,很多基因位点在不同报道中对先心病的影 响结果不尽相同E J2-1a],因此,原因一方面考虑实 验样本量的影响,另一方面也表明,先心病高危基 因的位点是可能存在多态性的,哪些位点是真正与 先心病发生密切相关的,仍需要进一步研究。 GI Il基因编码一类具有5个锌指DNA结合 基序的转录因子,既往研究认为GLI1基因可能与 GLI2相互协同,影响下游心脏特异性基因如GA— TA4、NKX2.5的表达,进而参与心脏发育_1 。 邱广蓉等_】o]对于180例单纯性先心病患者的研究 认为,GLI1基因在东北人群中很可能与单纯性先 心病相关,认为2101G>A基因在东北人群中可能 不存在多态性,而2914G>C基因的杂合突变很可 能与先心病的发病相关。本实验研究发现2101G>A 的杂合突变与先心病的发生可能相关,而2914G>C 在人群中存在多态性,但并未发现与先心病密切相 关,可能与人群的地域差异相关。 经过分析位点联合突变情况,虽然先心组中存 在一个病例同时存在多个突变位点情况,但是与对 照组比较并未发现统计学差异。由于样本量, 我们只发现GI I1基因的一个突变位点具有统计学 差异,而其他位点突变是否为基因多态性不明确。 在遗传方面,大多数样本突变情况符合孟德尔 遗传定律,仅19例不符合孟德尔定律的突变。其 中15例GLI1基因2101G>A的杂合突变 (78.9 )均不符合孟德尔遗传定律,因此考虑该 突变大部分与遗传无关,而先心病胎儿父母双方均 为健康人群,因此在遗传方面进一步证实了该位点 突变并非来自先心病胎儿的健康父母,该位点很可 能是导致先心病的位点之一。 综上所述,本研究于所检测的150例标本16 个基因的60个位点中发现突变位点主要集中在 TBX20、GATA4、GATA6、GI I1、CRELD1这 5个基因中,它们可能是中国北京附近人群的高突 变基因。在所检测到的13个突变位点中,GLI1基 因2101G ̄A的杂合突变结果具有统计学意义,且 大多数突变并非来自于父母遗传,提示该基因位点 的突变可能与先心病的发病密切相关。 参考文献 El1 Goldmuntz E.The epidemiology and genetics of congenital heart disease.Clin Perinatol,2001,28:1—10. 1-23 麦青,朱晓毅,刘党.2000--2004年北京市东城区围产儿 先天性心脏病发病情况分析.中国妇幼保健,2006,21: 2715—2717. E3]Lee W,Allan L,Carvalho js,et a1.ISUOG consensus state— ment:what constitutes a fetal echocardiogram?Ultrasound Ohstet Gynecol,2008,32:239—242. E4]Tian L,Zhu JF,Yang JG,et al,Missense mutations in CSX/NKX2.5 are associated with atrial septal defects. Journal of Nanjing Medica1 University,2007,21:218— 221. Es] Yang J,Hu D,Xia J,et a1.Three novel TBX5 mutations in Chinese patients with Holt—Oram syndrome,Am J Med Genet,2000,92:237—240. [6]Liu CX,Shen AD,Li XF,et al T—box transcription factor TBX20 mutations in Chinese patients with congenita1 heart disease.European Journal of Medical Genetics,2008,51: 580—587. [7] Zhang wM,Li XF,Shen AD,et al,GATA4 mutations in 486 Chinese patients with congenital heart disease.European Journal of Medical Genetics,2008,51:527—535. E83 Kodo K,Nishizawa T,Furutani M,et a1.GATA6 muta tions cause human cardiac outflow tract defects by disrupting semaphorin—plexin signaling.Proc Nat Acad Sci,2009, 106:13933—13938. E93 Xiong F,Li Q,Zhang CM,et al,Analyses of GATA4, NKX2.5,and TFAP2B genes in subjects from southern China with sporadic congenital heart disease.Cardiovascular Pathology,2013,22:141—145. [1O]邱广蓉,韩秀敏,官立国,等.GIm基因内2个SNP位点 与单纯性先天性心脏病的关联研究.中国实用内科杂志, 2006,26:1056—1058. [】1]袁浪,李波,郭颖,等.CREI D1基因在汉族先天性房室隔 缺损患儿中的突变分析.1临床儿科杂志,2010,28:1145一 l148. [12]Li Q,Pan H,Guan LN,et a1. CITED2 mutation links congenital heart defects to dysregulation of the cardiac gene VEGF and PITX2C expression.Biochemical and Biophysical Research Communications,2012,423:895—899. [13] Shen L,Li XF,Shen AD,et al,Transcription factor HAND2 mutations in sporadic Chinese patients with congenital heart disease.Chinese Medical Journal,2010,123:1623一 l627. [14]Hoffmann AD,Peterson MA,Friedland—Little JM,et a1. sonic hedgehog is required in pulmonary endoderm for atrial septation.Development,2009,136:1761—1770. (收稿日期:2013—12—30) 

因篇幅问题不能全部显示,请点此查看更多更全内容

Copyright © 2019- baoaiwan.cn 版权所有 赣ICP备2024042794号-3

违法及侵权请联系:TEL:199 18 7713 E-MAIL:2724546146@qq.com

本站由北京市万商天勤律师事务所王兴未律师提供法律服务