总公司与分公司之间的管理费该依照下列方式入账：
1、签订协议，以协议入账；
2、分公司作为费用，总公司作为收入，对总分机构之间因总机构提供管理服务而分摊的合理管理费，通过总分机构自动汇总得到解决，不会缴纳企业所得税。
一、办事处和分公司的区别有哪些
分支机构主要有两种形式：
1、分支机构；
2、办事处。
分公司可从事经营活动，而办事处一般只能从事总公司经营范围内的业务联络活动。分公司、办事处的税收待遇不同，主要体现在企业所得税和流转税上。从企业所得税的角度来看，由于办事处不能从事经营活动，没有业务收入，没有利润，所以没有应纳税所得额，没有企业所得税；对分公司而言，企业所得税可以在分公司所在地的税务机关缴纳，也可以在总公司汇总后集中缴纳。
二、分公司是什么
分公司是无法人资格的管辖分支机构。分公司属于分公司，在法律和经济上没有性，只是总公司的附属机构。分公司没有自己的名称、章程、财产，以总公司的资产对分公司的债务承担法律责任。分公司是总公司的分支机构，分公司的财产是总公司的一部分，只有经营使用权，不享有所有权，外部责任的范围不受分公司经营管理的财产的。
三、总公司和分公司、子公司的关系
总公司管理分公司，对所属分公司在生产经营、资金调度、人事管理等方面行使指挥、管理、监督的权利，具有法人资格，可以承担民事责任。分公司是与总公司相对应的法律概念，是指在业务、资金、人事等方面受总公司管理，不具有法人资格的分支机构。分公司在法律、经济上没有性，属于总公司的附属机构。
子公司和总公司一样，都是的法人，可以作为法人进行相应的各类活动，子公司若有责任在子公司的责任范围内负责。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国公司法》第十四条
公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。
公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法承担民事责任。
