法律分析：不论是行政案件，还是刑事案件，只要机关处理后，都要作为案件档案留存。一是为了保存案件材料，以备上级核查和备案二是为了给案件当事人(包括被处理人和办案人)在对该案进行复核时有案可查。三是为了确保将来被处理人再次出现违法甚至犯罪时，作为其曾经的经历，作为处理的参考依据。所以，案件材料是不会自动消除的。除非被处理人死亡一段时间后，机关会作为过期档案处理掉。
法律依据：《机关办理刑事案件程序规定》
第一百七十一条 对接受的案件，或者发现的犯罪线索，机关应当迅速进行审查。对于在审查中发现案件事实或者线索不明的，必要时，经办案部门负责人批准，可以进行初查。初查过程中，机关可以依照有关法律和规定采取询问、查询、勘验、鉴定和调取证据材料等不被调查对象人身、财产权利的措施。
第一百七十五条 机关接受案件后，经审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任，且属于自己管辖的，经县级以上机关负责人批准，予以立案；认为没有犯罪事实，或者犯罪事实显著轻微不需要追究刑事责任，或者具有其他依法不追究刑事责任情形的，经县级以上机关负责人批准，不予立案。
