夫妻双方签订的出轨协议有效。
婚内出轨协议是一种合同行为，当事人之间包括夫妻，兄弟，或其它关系人依法建立，体现了当事人直实意愿，且不违反法律法规与社会公称良俗而成就的协议都具有法律效力。
比如夫妻间财产的处理，子女的抚养，夫妻间责任义务的分担等都具有法律效力。但涉及到夫妻关系的解除与变更须按规定进行登记，用协议解除婚姻关系是无效协议。
有下列情形之一的，合同无效：
1、一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益；
2、恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益；
3、以合法形式掩盖非法目的；
4、损害社会公共利益；
5、违反法律、行规的强制性规定。
合同生效应具有的条件如下：
1、合同当事人具有相应的民事权利能力和民事行为能力；
2、合同当事人意思表示真实；
3、合同不违反法律或者社会公共利益；
4、具备法律、行规规定的合同生效必须具备的形式要件。
综上所述，婚内出轨后，协议如果没有法定无效事由就是有效的。协议属于合同的一种形式，只要符合合同的生效要件，并且没有法定的无效事由，就会发生法律效力。
【法律依据】：
《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。
第五百零七条
合同不生效、无效、被撤销或者终止的，不影响合同中有关解决争议方法的条款的效力。
第五百零六条
合同中的下列免责条款无效：
（一）造成对方人身损害的；
（二）因故意或者重大过失造成对方财产损失的。
