（1）骨髓检查可用于造血系统疾病的诊断，如对白血病的鉴别诊断，对各种贫血的鉴别诊断、多发性骨髓瘤和血小板增加或减少性疾病的诊断。
（2）某些感染性疾病，如感染性心内膜炎时的骨髓培养有助于提高该病诊断的阳性率，在疟原虫和黑热病原虫感染时，骨髓检查有助于发现原虫并明确诊断。
（3）某些恶性肿瘤时，骨髓检查可以确定是否有骨髓转移，因为骨髓是许多恶性肿瘤转移的好发部位。肺癌、乳腺癌、胃癌、前列腺癌易发生骨髓转移，骨髓检查可发现相应的肿瘤细胞。
（4）用于骨髓干细胞培养、染色体核型检查、骨髓细胞免疫学分型试验等。
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