根据法律的规定，一般机关在处理行政或刑事案件时，对于需要鉴定的，费用都由机关承担。对于处理您的案件机关的行为，应当是违法的，您可以向上级机关进行举报、投诉要求其退还鉴定费用。
若已构成刑事案件，鉴定费用更应当是由机关承担，因为该为机关搜集证据的侦查程序，不应当叫犯罪嫌疑人或者受害人承担。
一、打架斗殴派出所如何处理？
派出所会安排法医鉴定，根据鉴定结果来决定打人者的法律责任。
1、如果鉴定是轻微伤，机关对打人者进行治安处罚，并承担受害人的医疗费、误工费等费用。
《治安管理处罚法》第四十三条：“殴打他人的，或者故意伤害他人身体的，处五日以上十日以下拘留，并处二百元以上五百元以下罚款；情节较轻的，处五日以下拘留或者五百元以下罚款。
有下列情形之一的，处十日以上十五日以下拘留，并处五百元以上一千元以下罚款：
(一)结伙殴打、伤害他人的；
(二)殴打、伤害残疾人、孕妇、不满十四周岁的人或者六十周岁以上的人的；
(三)多次殴打、伤害他人或者一次殴打、伤害多人的。”
2、如果鉴定结果是轻伤，机关应当立案侦查，追究打人者的刑事责任。若机关不予立案，可以向人民提起刑事自诉，要求追究打人者的刑事责任。不管是公诉还是自诉，都可以同时提起附带民事诉讼，要求对方赔偿医疗等费用。
故意伤害他人身体的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。犯前款罪，致人重伤的，处三年以上十年以下有期徒刑；致人死亡或者以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。本法另有规定的，依照规定。
打架斗殴要处拘留或罚款，打架斗殴的处理方法分为两种情况，两种情况的处罚结果不同，如果司法机构鉴定为轻微伤，可以对打人者进行治安处罚，并要求其赔偿受害者的医疗费误工费等。如果鉴定为轻伤，应当由机关立案侦查，追究刑事责任。
二、交通事故处理过程还需要交费吗
交通事故处理过程一般不需要交费，但是当事人自己委托鉴定的需要自己承担费用。
《道路交通事故处理程序规定》第五十条规定，检验、鉴定费用由机关交通管理部门承担，但法律规定另有规定或者当事人自行委托伤残评定、财产损失评估的除外。
第五十规定，自检验报告、鉴定意见确定之日五日内，机关交通管理部门应当通知当事人领取扣留的事故车辆。
因扣留车辆发生的费用由作出决定的机关交通管理部门承担，但机关交通管理部门通知当事人领取，当事人逾期未领取产生的停车费用由当事人自行承担。
经通知当事人三十日以后不领取的车辆，经公告三个月仍不领取的，对扣留的车辆依法处理。
【本文关联的相关法律依据】
《机关办理行政案件程序规定》第九十七条办案人民应当对鉴定意见进行审查。
对经审查作为证据使用的鉴定意见，机关应当在收到鉴定意见之日起五日内将鉴定意见复印件送达违法嫌疑人和被侵害人。
医疗机构出具的诊断证明作为机关认定人身伤害程度的依据的，应当将诊断证明结论书面告知违法嫌疑人和被侵害人。
违法嫌疑人或者被侵害人对鉴定意见有异议的，可以在收到鉴定意见复印件之日起三日内提出重新鉴定的申请，经县级以上机关批准后，进行重新鉴定。同一行政案件的同一事项重新鉴定以一次为限。
当事人是否申请重新鉴定，不影响案件的正常办理。
机关认为必要时，也可以直接决定重新鉴定。
