灰色三部曲顺序为《灰色的果实》《灰色的迷宫》《灰色的乐园》。这是因为这三部作品是相互关联的，前一部作品的结尾为后一部作品的开头，形成了一个完整的故事情节。因此，灰色三部曲的顺序是《灰色的果实》《灰色的迷宫》《灰色的乐园》。《灰色的果实》是私立美滨学园的故事，描述了主人公风见雄二转入这所只有五名学生的学园后的生活及一系列事件。《灰色的迷宫》是《灰色的果实》的续作，内容收录了果实里五位女主角的后日谈，并加入其他新剧本，同时还有前传故事，介绍男主角雄二过去的“Caprice之茧”路线。《灰色的乐园》是前两部作品的完结篇，承接前作剧本“Caprice之茧”，讲述主人公风见雄二在被西斯奥斯罗“抓走”之后的故事。
