主办单位、学校位置、在校人数不同。
1、主办单位：合肥工业大学宣城校区：是由合肥工业大学、宣城市共同建设的；合肥工业大学本校区：是中华人民共和国教育部直属全国重点大学，教育部、工信部和安徽省共建高校，国防科工局与教育部共建高校。
2、学校位置：合肥工业大学宣城校区：坐落在有“中国文房四宝之乡”之称的宣城市区南部，这里风景秀丽，环境优美，交通便利，文化底蕴深厚；合肥工业大学本校区：位于合肥市，学校占地总面积5000余亩，在合肥市设有屯溪路校区、翡翠湖校区、六安路校区和合肥工业大学智能制造技术研究院。
3、在校人数：合肥工业大学宣城校区：在校本科生11000余名，研究生200名；合肥工业大学本校区：在校全日制本科生3.2万余人、硕士和博士研究生1.3万余人。设有23院部，本科专业91个。
