黄体素分泌减少，雌激素相对增多是重要的乳腺小叶增生的病因。如卵巢发育不健全、月经不调、甲状腺疾病及肝功能障碍等。
情绪等精神因素的影响
精神紧张、情绪激动等不良精神因素容易形成乳腺小叶增生，经常熬夜、睡眠不足等也会造成乳腺小叶增生，而且这些不良因素还会加重已有的乳腺小叶增生症状。这些都是常见的乳腺小叶增生的病因。
人为因素或不良生活习惯女性高龄不孕、性生活失调、人工流产、夫妻不和、不哺乳等都是乳腺小叶增生的病因，造成乳腺不能有正常的、周期性的生理活动。佩戴过紧的胸罩或穿过紧的内衣等等。
饮食结构不合理饮食结构不合理也是常见的乳腺小叶增生的病因，如高脂、高能量饮食导致脂肪摄入过多，饮酒和吸烟等不良生活习惯会诱发乳腺疾病。此外，现在人们的饮食好了，有高血压、高血糖病的人也很多，这些也容易使女性出现内分泌失调，导致乳腺小叶增生。
长期服用避孕药人体长期过量摄入雌激素，将导致内分泌平衡失调，现在一些速生食品、人工饲养的水产及家禽使用的饲料中也多含有激素成分，长期食用也会导致乳腺疾病的发生。
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